Setting the alignment of the div doesn't work and isn't a valid element. The best solution I could find is:
<div style="float: left; width: 63%;>
<telerik:RadHtmlChart ID="PieChart1" runat="server" Width="100%" Height="100%">
<Legend>
<Appearance Visible="false">
</Appearance>
</Legend>
<PlotArea>
<Series>
<telerik:PieSeries Name="PieSeries1" StartAngle="90">
<SeriesItems>
<telerik:PieSeriesItem BackgroundColor="#c20000" Exploded="True" Name="A" Y="40" />
<telerik:PieSeriesItem BackgroundColor="#ff7a00" Name="B" Y="20" />
<telerik:PieSeriesItem BackgroundColor="#ffc700" Name="C" Y="10" />
<telerik:PieSeriesItem BackgroundColor="#8dcb2a" Name="D" Y="10" />
<telerik:PieSeriesItem BackgroundColor="#2a94cb" Name="E" Y="10" />
<telerik:PieSeriesItem BackgroundColor="#800080" Name="F" Y="10" />
</SeriesItems>
</telerik:PieSeries>
</Series>
</PlotArea>
</telerik:RadHtmlChart>
</div>
<div style="float: right; width: 37%;>
<telerik:RadHtmlChart ID="PieChart1" runat="server" Width="100%" Height="100%">
<Legend>
<Appearance Position="Right" Visible="true">
</Appearance>
</Legend>
<PlotArea>
<Series>
<telerik:PieSeries Name="PieSeries1" StartAngle="90">
<SeriesItems>
<telerik:PieSeriesItem BackgroundColor="#c20000" Name="A" Y="40" />
<telerik:PieSeriesItem BackgroundColor="#ff7a00" Name="B" Y="20" />
<telerik:PieSeriesItem BackgroundColor="#ffc700" Name="C" Y="10" />
<telerik:PieSeriesItem BackgroundColor="#8dcb2a" Name="D" Y="10" />
<telerik:PieSeriesItem BackgroundColor="#2a94cb" Name="E" Y="10" />
<telerik:PieSeriesItem BackgroundColor="#800080" Name="F" Y="10" />
</SeriesItems>
</telerik:PieSeries>
</Series>
</PlotArea>
</telerik:RadHtmlChart>
</div>
<div style="float: left; width: 63%;>
<telerik:RadHtmlChart ID="PieChart1" runat="server" Width="100%" Height="100%">
<Legend>
<Appearance Visible="false">
</Appearance>
</Legend>
<PlotArea>
<Series>
<telerik:PieSeries Name="PieSeries1" StartAngle="90">
<SeriesItems>
<telerik:PieSeriesItem BackgroundColor="#c20000" Exploded="True" Name="A" Y="40" />
<telerik:PieSeriesItem BackgroundColor="#ff7a00" Name="B" Y="20" />
<telerik:PieSeriesItem BackgroundColor="#ffc700" Name="C" Y="10" />
<telerik:PieSeriesItem BackgroundColor="#8dcb2a" Name="D" Y="10" />
<telerik:PieSeriesItem BackgroundColor="#2a94cb" Name="E" Y="10" />
<telerik:PieSeriesItem BackgroundColor="#800080" Name="F" Y="10" />
</SeriesItems>
</telerik:PieSeries>
</Series>
</PlotArea>
</telerik:RadHtmlChart>
</div>
<div style="float: right; width: 37%;>
<telerik:RadHtmlChart ID="PieChart1" runat="server" Width="100%" Height="100%">
<Legend>
<Appearance Position="Right" Visible="true">
</Appearance>
</Legend>
<PlotArea>
<Series>
<telerik:PieSeries Name="PieSeries1" StartAngle="90">
<SeriesItems>
<telerik:PieSeriesItem BackgroundColor="#c20000" Name="A" Y="40" />
<telerik:PieSeriesItem BackgroundColor="#ff7a00" Name="B" Y="20" />
<telerik:PieSeriesItem BackgroundColor="#ffc700" Name="C" Y="10" />
<telerik:PieSeriesItem BackgroundColor="#8dcb2a" Name="D" Y="10" />
<telerik:PieSeriesItem BackgroundColor="#2a94cb" Name="E" Y="10" />
<telerik:PieSeriesItem BackgroundColor="#800080" Name="F" Y="10" />
</SeriesItems>
</telerik:PieSeries>
</Series>
</PlotArea>
</telerik:RadHtmlChart>
</div>